Полимеразно верижна реакција за детекција на SARS CoV-2 вирус и варијанти
Објавено 2022-06-23
Клучни зборови
- SARS-CoV-2 вирус,
- РТ-ПВР,
- варијанти на загриженост,
- варијанти на интерес
Како да се цитира
Авторско право(c) 2021 Aneta Peshnachka, Golubinka Boshevska, Nevenka Velichkova, Elizabeta Jancheska, Maja Vukovikj, Teodora Buzharova, Gordana Nikolovska, Ardian Preshova, Shaban Memeti
![Creative Commons License](http://i.creativecommons.org/l/by/4.0/88x31.png)
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Апстракт
Првите хумани случаи на болеста КОВИД-19 (coronavirus disease 2019- COVID-19), болест предизвикана од новиот коронавирус, за прв пат се пријавени на 31 декември 2019 година во НР Кина, кога вирусот го добил привременото име 2019 нов коронавирус (2019 novel coronavirus -2019-nCoV) или подоцна SARS-CoV-2. Целта на овој труд е да се прикаже процесот на лабораториска детекција на SARS-CoV-2 вирусот со реверзна транскриптаза - полимеразно верижна реакција (РТ-ПВР) во реално време, како и протоколот за детекција на варијантите на SARS-CoV-2 во Лабораторијата за вирусологија при Институтот за јавно здравје (ИЈЗ). Тестирани се примероци од суспектни пациенти за КОВИД-19 од територијата на цела држава за лабораториска детекција на SARS-CoV-2. Примероците пристигнуваат од 10-те регионални центри за јавно здравје (ЦЈЗ), од хоспитализирани пациенти од ковид болниците низ државата и од пунктот за ковид при ИЈЗ. Сите примероци се тестирани со примена на РТ-ПВР во реално време со детекција на различни гени на вирусот. Дополнителни анализи се прават за идентификација на циркулирачките варијанти. Континуираниот надзор на варијантите за загриженост (variants of concern - VOC), како и новонастанатите варијанти може да им овозможат на здравствените служби да го модифицираат својот пристап кон процесот на контрола и управување на болеста и да интервенираат ефикасно и навремено, со цел да се спречи голем морбидитет и смртност од КОВИД-19.
Downloads
Референци
- "WHO Director-General's opening remarks at the media briefing on COVID-19—11 March 2020". World Health Organization. Retrieved 11 March 2020
- Yong SK, Su PC, Yang YS. Molecular Targets for the Testing of COVID-19. Biotechnol J. 2020 Jun;15(6):e2000152. DOI: https://doi.org/10.1002/biot.202000152
- WHO/COVID-19 Weekly Epidemiological Update, Edition 42, published 1 June 2021
- Работно упатство за начин на земање примероци од лица суспектни за КОВИД -19. Институт за јавно здравје достапно на: http://iph.mk
- http://iph.mk/postapka-za-transport-na-primeroci-za-laboratoriska-analiza-za-sars-cov-2-covid-19-od-bolnici-centri-za-javno-zdravje-i-sobirni-punktovi/
- Guidance on regulations for the transport of infectious substances 2019 – 2020: applicable from 1 January 2019. Available at: https://apps.who.int/iris/handle/10665/325884
- QIAGEN®, QIAamp® Viral RNA Mini Handbook. Available at: https://www.qiagen.com › resources
- Maccura Biotechnology Co., Ltd, Mag-Bind RNA Extraction Kit. Available at: https://www.maccura.com/en/product
- Viral DNA and RNA Extraction kit (Plate). Available at: https://aitbiotech.com/abGenix
- SaMag-96 Nucleic Acids Purification System Available at: https://sacace.com/public_ftp/sacace-samag-96.zip
- Thermo Scientific™- MagMAX™ Viral/Pathogen II Nucleic Acid, Isolation Kit достапно на: https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/A48383#/A48383
- Xpert® Xpress SARS-CoV-2. Available at https://www.cepheid.com/en_US/tests/Critical-Infectious-Diseases/Xpert-Xpress-SARS-CoV-2
- Allplex 2019-nCoV Assay. Available at: https://www.seegene.com/assays/allplex_2019_ncov_assay#
- BGI’s Real-Time Fluorescent RT-PCR kit Available at: https://www.bgi.com/global/molecular-genetics/2019-ncov-detection-kit/
- Sansure Biotech. Available at:
- http://www.sansureglobal.com/product/novel-coronavirus2019-ncov-nucleic-acid-diagnostic-kit-pcr-fluorescence-probing-2/
- Charite- Diagnostic detection of Wuhan coronavirus 2019 by real-time RT-PCR Available at:https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/protocol-v2-1.pdf
- RealTime SARS-CoV-2. Available at: https://www.euroimmun.com/products/molecular-genetic-diagnostics/pd/molecular-infection-diagnostics/sars-cov-2/2606/8/104696/
- TaqMan 2019-nCoV Assay Kit v1 Available at: https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/A47532#/A47532
- SARS-CoV-2 Fluorescent PCR. Available at: https://www.fda.gov/media/137026/download, SARS-CoV-2 Fluorescent PCR Kit, Maccura
- TaqPath™ COVID-19 Combo Kit, Multiplex real-time RT-PCR test intended for the qualitative detection of nucleic acid from SARS CoV 2. Available at: thermofisher.com
- SARS-CoV-2/Influenza Multiplex. Available at: www.dna-technology.ru/SARS-CoV2
- Genrui SARS-CoV-2 Detection Kit. Available at: http://www.genrui-bio.com/products-detail.php?ProId=74
- WHO/Europe & ECDC Methods for the detection and identification of SARS-CoV-2 variants March. 2021; Available at: https://www.euro.who.int/en/health-topics/health-emergencies/coronavirus-covid-19/publications-and-technical-guidance/2021/methods-for-the-detection-and-identification-of-sars-cov-2-variants,-march-2021
- SARS-CoV-2 Variant Plus RT-qPCR. Available at: https://www.bioeksen.com.tr/en/biospeedy--sars cov2-variant-plus
- VirSNiP SARS-CoV-2 Spike N501Y Available at: https://www.tib-molbiol.de/covid-19#nav-644
- WHO. Laboratory biosafety guidance related to coronavirus disease (COVID-19), Interim guidance. 2020, Available at https://www.who.int/publications/i/item/laboratory-biosafety-guidance-related-to-coronavirus-disease-(covid-19)
- World Health Organization. Diagnostic testing for SARS-CoV-2: interim guidance. 2020. Available at: https://apps.who.int/iris/handle/10665/334254. License: CC BY-NC-SA 3.0 IGO
- Guidance for surveillance of SARS-CoV-2 variants Available at: https://www.who.int/publications/i/item/WHO_2019-nCoV_surveillance_variants