Том. 14 Бр. 1 (2022): Архиви на јавно здравје
Јавно здравје

Полимеразно верижна реакција за детекција на SARS CoV-2 вирус и варијанти

Анета Пешначка
Институт за јавно здравје на Република Северна Македонија, Скопје, Република Северна Македонија
Голубинка Бошевска
Институт за јавно здравје на Република Северна Македонија, Скопје, Република Северна Македонија
Невенка Величкова
Универзитет Гоце Делчев, Штип, Факултет за медицински науки, Република Северна Македонија
Елизабета Јанческа
Институт за јавно здравје на Република Северна Македонија, Скопје, Република Северна Македонија
Маја Вуковиќ
Институт за јавно здравје на Република Северна Македонија, Скопје, Република Северна Македонија
Теодора Бужарова
Институт за јавно здравје на Република Северна Македонија, Скопје, Република Северна Македонија
Гордана Николовска
Институт за јавно здравје на Република Северна Македонија, Скопје, Република Северна Македонија
Ардиан Прешова
Институт за јавно здравје на Република Северна Македонија, Скопје, Република Северна Македонија
Шабан Мемети
Институт за јавно здравје на Република Северна Македонија; Универзитет Св. Кирил и Методиј во Скопје, Медицински факултет, Република Северна Македонија

Објавено 2022-06-23

Клучни зборови

  • SARS-CoV-2 вирус,
  • РТ-ПВР,
  • варијанти на загриженост,
  • варијанти на интерес

Како да се цитира

1.
Пешначка А, Бошевска Г, Величкова Н, Јанческа Е, Вуковиќ М, Бужарова Т, Николовска Г, Прешова А, Мемети Ш. Полимеразно верижна реакција за детекција на SARS CoV-2 вирус и варијанти . Arch Pub Health [Internet]. 2022 Jun. 23 [cited 2024 Jul. 16];14(1):1-11. Available from: https://id-press.eu/aph/article/view/6030

Апстракт

Првите хумани случаи на болеста КОВИД-19 (coronavirus disease 2019- COVID-19), болест предизвикана од новиот коронавирус, за прв пат се пријавени на 31  декември 2019 година во НР Кина, кога вирусот го добил привременото име 2019 нов коронавирус (2019 novel coronavirus -2019-nCoV) или подоцна SARS-CoV-2. Целта на овој труд е да се прикаже процесот на лабораториска детекција на SARS-CoV-2 вирусот со реверзна транскриптаза - полимеразно верижна реакција (РТ-ПВР) во реално време, како и протоколот за детекција на варијантите на SARS-CoV-2 во Лабораторијата за вирусологија при Институтот за јавно здравје (ИЈЗ). Тестирани се примероци од суспектни пациенти за КОВИД-19 од територијата на цела држава за лабораториска детекција на SARS-CoV-2. Примероците пристигнуваат од 10-те регионални центри за јавно здравје (ЦЈЗ), од хоспитализирани пациенти од ковид болниците низ државата и од пунктот за ковид при ИЈЗ. Сите примероци се тестирани со примена на РТ-ПВР во реално време со детекција на различни гени на вирусот. Дополнителни анализи се прават за идентификација на циркулирачките варијанти. Континуираниот надзор на варијантите за загриженост (variants of concern - VOC), како и новонастанатите варијанти може да им овозможат на здравствените служби да го модифицираат својот пристап кон процесот на контрола и управување на болеста и да интервенираат ефикасно и навремено, со цел да се спречи голем морбидитет и смртност од КОВИД-19.

Downloads

Download data is not yet available.

Референци

  1. "WHO Director-General's opening remarks at the media briefing on COVID-19—11 March 2020". World Health Organization. Retrieved 11 March 2020
  2. Yong SK, Su PC, Yang YS. Molecular Targets for the Testing of COVID-19. Biotechnol J. 2020 Jun;15(6):e2000152. DOI: https://doi.org/10.1002/biot.202000152
  3. WHO/COVID-19 Weekly Epidemiological Update, Edition 42, published 1 June 2021
  4. Работно упатство за начин на земање примероци од лица суспектни за КОВИД -19. Институт за јавно здравје достапно на: http://iph.mk
  5. http://iph.mk/postapka-za-transport-na-primeroci-za-laboratoriska-analiza-za-sars-cov-2-covid-19-od-bolnici-centri-za-javno-zdravje-i-sobirni-punktovi/
  6. Guidance on regulations for the transport of infectious substances 2019 – 2020: applicable from 1 January 2019. Available at: https://apps.who.int/iris/handle/10665/325884
  7. QIAGEN®, QIAamp® Viral RNA Mini Handbook. Available at: https://www.qiagen.com › resources
  8. Maccura Biotechnology Co., Ltd, Mag-Bind RNA Extraction Kit. Available at: https://www.maccura.com/en/product
  9. Viral DNA and RNA Extraction kit (Plate). Available at: https://aitbiotech.com/abGenix
  10. SaMag-96 Nucleic Acids Purification System Available at: https://sacace.com/public_ftp/sacace-samag-96.zip
  11. Thermo Scientific™- MagMAX™ Viral/Pathogen II Nucleic Acid, Isolation Kit достапно на: https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/A48383#/A48383
  12. Xpert® Xpress SARS-CoV-2. Available at https://www.cepheid.com/en_US/tests/Critical-Infectious-Diseases/Xpert-Xpress-SARS-CoV-2
  13. Allplex 2019-nCoV Assay. Available at: https://www.seegene.com/assays/allplex_2019_ncov_assay#
  14. BGI’s Real-Time Fluorescent RT-PCR kit Available at: https://www.bgi.com/global/molecular-genetics/2019-ncov-detection-kit/
  15. Sansure Biotech. Available at:
  16. http://www.sansureglobal.com/product/novel-coronavirus2019-ncov-nucleic-acid-diagnostic-kit-pcr-fluorescence-probing-2/
  17. Charite- Diagnostic detection of Wuhan coronavirus 2019 by real-time RT-PCR Available at:https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/protocol-v2-1.pdf
  18. RealTime SARS-CoV-2. Available at: https://www.euroimmun.com/products/molecular-genetic-diagnostics/pd/molecular-infection-diagnostics/sars-cov-2/2606/8/104696/
  19. TaqMan 2019-nCoV Assay Kit v1 Available at: https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/A47532#/A47532
  20. SARS-CoV-2 Fluorescent PCR. Available at: https://www.fda.gov/media/137026/download, SARS-CoV-2 Fluorescent PCR Kit, Maccura
  21. TaqPath™ COVID-19 Combo Kit, Multiplex real-time RT-PCR test intended for the qualitative detection of nucleic acid from SARS CoV 2. Available at: thermofisher.com
  22. SARS-CoV-2/Influenza Multiplex. Available at: www.dna-technology.ru/SARS-CoV2
  23. Genrui SARS-CoV-2 Detection Kit. Available at: http://www.genrui-bio.com/products-detail.php?ProId=74
  24. WHO/Europe & ECDC Methods for the detection and identification of SARS-CoV-2 variants March. 2021; Available at: https://www.euro.who.int/en/health-topics/health-emergencies/coronavirus-covid-19/publications-and-technical-guidance/2021/methods-for-the-detection-and-identification-of-sars-cov-2-variants,-march-2021
  25. SARS-CoV-2 Variant Plus RT-qPCR. Available at: https://www.bioeksen.com.tr/en/biospeedy--sars cov2-variant-plus
  26. VirSNiP SARS-CoV-2 Spike N501Y Available at: https://www.tib-molbiol.de/covid-19#nav-644
  27. WHO. Laboratory biosafety guidance related to coronavirus disease (COVID-19), Interim guidance. 2020, Available at https://www.who.int/publications/i/item/laboratory-biosafety-guidance-related-to-coronavirus-disease-(covid-19)
  28. World Health Organization. Diagnostic testing for SARS-CoV-2: interim guidance. 2020. Available at: https://apps.who.int/iris/handle/10665/334254. License: CC BY-NC-SA 3.0 IGO
  29. Guidance for surveillance of SARS-CoV-2 variants Available at: https://www.who.int/publications/i/item/WHO_2019-nCoV_surveillance_variants